Trezorix werd in 2000 opgericht door een paar partijen die betrokken waren geweest bij de realisatie van een zeer succesvolle reeks tentoonstellingsapplicaties en internettoepassingen voor "het nieuwe Naturalis", dat als moderne variant van het oude Nationaal Natuurhistorisch Museum in 1998 in Leiden was geopend. Naturalis zelf was één van de initiatiefnemers van de oprichting van Trezorix. Het nieuwe bedrijf had als primair doel het ontwikkelen en beschikbaar maken van een webgebaseerde infrastructuur waarop Naturalis en andere inmiddels geïnteresseerde kennisinstellingen hun ambities als modern kennisaanbieder en netwerkorganisatie konden realiseren.
Vanuit die achtergrond heeft Trezorix zich ontwikkeld tot een specialist in het koppelen van allerlei bronnen tot kennisnetwerken en in het optimaal vindbaar maken van de informatie daarbinnen middels via referentiestructuren verbonden metadata. Trezorix werkt daarbij - als initiator en deelnemer - in allerlei projecten samen met kennisinstellingen, waaronder musea, bibliotheken, ministeries, universiteiten, en collega-bedrijven.
Inmiddels bestaat de klantenkring van Trezorix niet alleen meer uit de natuurhistorische instellingen en diverse soorten musea die in de beginjaren het klantprofiel voornamelijk bepaalden. Maar tot op heden zijn Trezorix en Naturalis nog steeds samen actief in het bedenken en ontwikkelen van toepassingen waarmee het natuurhistorisch museum en haar partners - waaronder grote en kleine natuurorganisaties, wetenschappelijke instellingen en het ministerie van LNV - zich op innovatieve wijze kunnen profileren als kennisinstelling, en hun informatie kunnen bundelen in een "kenniscluster rond biodiversiteit".